Polymorphism of LEP, PKM2 and CSN3 genes in Polish cold-blooded horse population

• Autorzy: Bohaczyk M. , Mroczkowski S.

Warianty tytułu

PL

Polimorfizm genów LEP, PKM2 i CSN3 w populacji polskich koni zimnokrwistych

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The aim of the study was to determine frequencies of leptin (LEP), pyruvate kinase M2 (PKM2) and kappa casein (CSN3) genes and genotypes in Polish cold-blooded horse population. The investigation was performed on 194 individuals. Genotyping of the selected genes was performed by PCR-RFLP technique with restriction enzymes TaqI (LEP gene), ApoI (PKM2), PstI and BseYI (CSN3). Frequencies of genes and alleles were as follows: LEP/TaqI AA – 0.1443, AB – 0.4897, BB – 0.3660, A – 0.3892, B – 0.6108; PKM2/ApoI AA – 0.0000, GA – 0.0979, GG – 0.9021, A – 0.0490, G – 0.9510; CSN3/PstI AA – 0.4948, AG – 0.5000, GG – 0.0052, A – 0.7448, G – 0.2552; CSN3/BseYI AA – 0.3866, AC – 0.3247, CC – 0.2887, A – 0.5490 and C – 0.4510. Any statistically significant differences in the observed frequencies of genotypes between mares and stallions’ groups were not found. In case of leptin and pyruvate kinase genes, the population was found in Hardy-Weinberg equilibrium.

PL

Celem badań było określenie frekwencji genów i genotypów leptyny (LEP), kinazy pirogronianowej M2 (PKM2) i kappa kazeiny (CSN3) w populacji polskich koni zimnokrwistych. Badaniami objęto 194 osobniki. Genotypowanie wybranych genów przeprowadzono metodą PCR-RFLP, z użyciem enzymów TaqI (gen LEP), ApoI (PKM2) oraz PstI i BseYI (CSN3). Częstość występowania genotypów i alleli w analizowanej populacji była następująca: LEP/TaqI AA – 0,1443, AB – 0,4897, BB – 0,3660, A – 0,3892, B – 0,6108; PKM2/ApoI AA – 0,0000, GA – 0,0979, GG – 0,9021, A – 0,0490, G – 0,9510; CSN3/PstI AA – 0,4948, AG – 0,5000, GG – 0,0052, A – 0,7448, G – 0,2552; CSN3/BseYI AA – 0,3866, AC – 0,3247, CC – 0,2887, A – 0,5490, C – 0,4510. Nie odnotowano statystycznie istotnych różnic w obserwowanych frekwencjach genotypów między grupami klaczy i ogierów. Populacja pozostawała w stanie równowagi genetycznej pod względem badanych genów, z wyjątkiem genu kappa kazeiny.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego
• Rocznik: 2011
• Tom: 07
• Numer: 3
• Opis fizyczny: p.9-19,ref.

Twórcy

autor

Bohaczyk M.

• Department of Genetics and General Animal Breeding, University of Technology and Life Sciences in Bydgoszcz, 28 Mazowiecka Street, 85-084 Bydgoszcz, Poland

autor

Mroczkowski S.

Bibliografia

• 1. BOLET G., DEVINOY E., VIRAG G., HARSANYI I., BOSZE Z., 2007 – Association between litter size and the κ-casein genotype in the INRA rabbit lines. World Rabbit Science 15, 147-150.
• 2. BOROWIEC-CHŁOPEK Ż., PIKUŁA R., 2008 – Polymorphism of leptin gene (LEP/TaqI) in horses according to their breed and utility type (Brief Report). Archiv für Tierzucht 51 (3), 295-297.
• 3. BUCHANAN F.C., VAN KESSEL A.G., WALDNER C., CHRISTENSEN D.A., LAARVELD B., SCHMUTZ S.M., 2003 – Hot topic: An association between a leptin single nucleotide polymorphism and milk and protein yield. Journal of Dairy Science 86, 3164-3166.
• 4. CAETANO A.R., POMP D., MURRAY J.D., BOWLING A.T., 1999 – Comparative mapping of 18 equine type I genes assigned by somatic cell hybrid analysis. Mammalian Genome 10, 271-276.
• 5. CARAVACA F., CARRIZOSA J., URRUTIA B., BAENA F., JORDANA J., AMILLS M., BADAOUI B., SANCHEZ A., 2009 – Short communication: Effect of αS1-casein (CSN1S1) and κ-casein (CSN3) genotypes on milk composition in Murciano-Granadina goats. Journal of Dairy Science 92, 2960-2964.
• 6. DALL’OLIO S., DAVOLI R., SCOTTI E., FONTANESI L., RUSSO V., 2007 – SNPs within the beta myosin heavy chain (MYH7) and the pyruvate kinase muscle (PKM2) genes in horse. Italian Journal of Animal Sciences 6, 421-428.
• 7. HAVLICEK Z., HARTMAN I., SABLIKOVA L., 1996 – Geneticke variant mlecnych protein a syrarske vlasnosti mleka. Book of Abstract, 17th Genetical Days, July 1-3, 117-118.
• 8. HENDERSON D.A., MARSHALL D.M., 1996 – Kappa casein genotype effects in multiple breed beef cattle population. Journal of Animal Sciences 77 (1), 121.
• 9. HOBOR S., KUNEJ T., DOVČ P., 2008 – Polymorphisms in the kappa casein (CSN3) gene in horse and comparative analysis of its promoter and coding region. Animal Genetics 39, 520-530.
• 10. HOBOR S., KUNEJ T., LENASI T., DOVČ P., 2006 – Kappa casein gene (CSN3) in horse: genetic variability in exon 1 and 4. Acta Agriculturae Slovenica 88 (2), 83-89.
• 11. KĘSZKA A., 2006 – Próba określenia zależności pomiędzy polimorfizmem w genie leptyny i wybranych białek krwi a wskaźnikami rozrodu klaczy stadnych. Praca doktorska (maszynopis). AR Szczecin.
• 12. KORWIN-KOSSAKOWSKA A., 2007 – Polimorfizm wybranych genów kandydujących na markery cech użytkowości rozpłodowej loch. Prace i Materiały Zootechniczne, Monografie i Rozprawy 19, 33-37.
• 13. KURYŁ J., PIERZCHAŁA M., KAPELAŃSKI W., BOCIAN M., GRAJEWSKA S., 2003 – A relationship between genotypes at the GH and LEP loci and carcass meat and fat deposition in pigs. Animal Science Papers and Reports 21 (1), 15-26.
• 14. LAGONIGRO R., WIENER P., PILLA F., WOOLLIAMS J.A., WILLIAMS J.L., 2003 – A new mutation in the coding region of bovine leptin gene associated with feed intake. Animal Genetic 34 (5), 371-374.
• 15. LIEFERS S.C., TE PAS M.F.W., VEERKAMP R.F., VAN DER LENDE T., 2002 – Association between leptin gene polymorphisms and production, live weight, energy balance, feed intake and fertility in Holstein heifers. Journal of Dairy Science 85, 1633-1638.
• 16. MADEJA Z., PIASECKA A., LECHNIAK D., ŚWITOŃSKI M., 2002 – Leptyna – polimorfizm genetyczny i rola w rozrodzie. Medycyna Weterynaryjna 58 (8), 572-576.
• 17. MIKOLÁŠOVÁ R., URBAN T., 2005 – Variability in the leptin, leptin receptor and heart fatty acid binding protein genes in relationship with meat quality traits in pigs. Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis 10, 87-94.
• 18. MOIOLI B., D’ANDREA M., PILLA F., 2007 – Candidate genes affecting sheep and goat milk quality. Small Ruminant Research 68, 179-192.
• 19. OPRZĄDEK J.M., 2007 – Charakterystyka genetyczna populacji polskiego bydła rasy czerwono-białej z uwzględnieniem polimorfizmu wybranych loci. Prace i Materiały Zootechniczne, Monografie i Rozprawy 18, 19-57.
• 20. Program hodowli koni rasy polski koń zimnokrwisty, 2006 – PZHK, Warszawa.
• 21. SELVAGGI M., DELFINO A.R.P., DARIO C., 2010 – Exon 1 polymorphisms in the equine CSN3 gene: SNPs distribution analysis in Murgese horse breed. Animal Biotechnology 21, 252-256.
• 22. SHEKAR P.C., GOEL S., RANI S.D., SARATHI D.P., ALEX J.L., SINGH S., KUMAR S., 2006 – κ-Casein-deficient mice fail to lactate. Proceeding of the National Academy of Sciences 103 (21), 8000-8005.
• 23. SIECZKOWSKA H., KOĆWIN-PODSIADŁA M., ZYBERT A., KRZĘCIO E., ANTOSIK K., KAMIŃSKI S., WÓJCIK E., 2010 – The association between polymorphism of PKM2 gene and glycolytic potential and pork meat quality. Meat Science 84, 180-185.
• 24. SIECZKOWSKA H., ZYBERT A., KRZĘCIO E., ANTOSIK K., KOĆWIN-PODSIADŁA M., PIERZCHAŁA M., URBAŃSKI P., 2010 – The expression of genes PKM2 and CAST in the muscle tissue of pigs differentiated by glycolytic potential and drip loss, with reference to the genetic group. Meat Science 84, 137-142.
• 25. Statsoft® Polska (2001). STATISTICA 6.0 PL. www.statsoft.pl
• 26. TSIARAS A.M., BARGOULI G.G., BANOS G., BOSCOS C.M., 2005 – Effect of kappacasein and beta-lactoglobulin loci on milk production traits and reproductive performance of Holstein cows. Journal of Dairy Science 88, 327-334.
• 27. XIE C., ALBRECHT E., WEGNER J., BROCKMANN G., KAZALA C., WESELAKE R.J., ENDER K., 1999 – Leptin, a palatability molecule? – A Review. Archiv für Tierzucht 42 , 191-199.
• 28. ZATOŃ M., 1999 – Znaczenie polimorfizmu kappa-kazeiny w hodowli bydła. Prace i Materiały Zootechniczne 54, 7-19.

Uwagi

PL

Rekord w opracowaniu.