PL
Klasyczne, oparte na posiewach i testach biochemicznych, metody wykrywania i różnicowania bakterii z rodzaju Alicyclobacillus zajmują kilka do kilkunastu dni. Metody molekularne, oparte na hybrydyzacji lub amplifikacji kwasów nukleinowych umożliwiają szybszą i niejednokrotnie bardziej precyzyjną charakterystykę badanych bakterii. Spośród opisywanych metod, najpopularniej stosowaną w diagnostyce rodzaju Alicyclobacillus jest analiza sekwencji genu 16S rDNA. Do metod molekularnych stosowanych w procesie wyodrębniania nowych gatunków w obrębie rodzaju Alicyclobacillus zaliczają się również analiza stosunku par G-C do par A-T, hybrydyzacja genomów oraz analiza sekwencji genu gyrB. Najbardziej uniwersalne metody różnicowania genetycznego, jak np. RAPD-PCR, nie wymagają znajomości sekwencji badanego DNA. Metoda LAMP-PCR ze względu na niskie koszty i specyficzność stanowi atrakcyjną alternatywę w odniesieniu do metod opartych na klasycznej reakcji PCR.
EN
Conventional methods of detecting and differentiation of Alicyclobacillus are based on plating and biochemical tests, and require several days do accomplish. Molecular methods are based on hybridization and amplification of DNA, and enable faster and more specific characterisation of tested bacteria. The most popular among all described methods, is the 16S rDNA sequence analysis. Molecular methods used in the process of describing new species belonging to Alicyclobacillus genus are also G-C content, genome hybridization, and gyrB gene sequence analysis. The most universal differentiation methods do not require any knowledge of the sequence of tested DNA. The LAMP-PCR method, due to it’s low cost and precision, is an attractive alternative to the classic PCR methods.