Cross-species hybridizations in situ for identification of Robertsonian translocation in wild boar

• Autorzy: Babicz M. , Danielak-Czech B. , Kozubska-Sobocinska A.

Warianty tytułu

PL

Międzygatunkowe hybrydyzacje in situ do identyfikacji translokacji Robertsonowskiej u dzika

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

Cross-species hybridizations in situ for identification of Robertsonian translocation in wild boar. Homologies and homeologies between human and pig chromosomes enabled human painting probes to be used for identification of chromosomes involved in homozygous centric fusion in the wild boar (Sus scrofa scrofa). with karyotype 36,XY,rob(15;17), which had been provisionally determined on the basis of G-bands (GTG technique). For interspecies hybridizations two commercial differently labelled human painting probes for chromosome pairs 2 and 20 were used. FISH with the human WCP 20 probe revealed green fluorescence signals on the short arms of the 15;17translocated chromosomes, and after hybridization with the WCP 2 yellow signals were observed along the long arms of these rearranged acrocentic autosomes as well as on small fragments of the SSC3q arms. The results of cross-species hybridizations in situ have confirmed preliminary cytogenetic evaluation of the karyotype of the Robertsonian translocation-carrying wild boar as well as numerous homologies and homeologies between chromosomes of human and species (Sus scrofa domestica and Sus scrofa scrofa) belonging to the Suidae family. The results obtained have confirmed alsothe usefulness of commercial human painting probes for identification of chromosome rearrangements in other species that received little study.

PL

Międzygatunkowe hybrydyzacje in situ do identyfikacji translokacji Robertsonowskiej u dzika. Homologie i homeologie między chromosomami człowieka i świni domowej umożliwiły zastosowanie ludzkich sond malujących do identyfikacji chromosomów zaangażowanych w homozygotyczną fuzję centryczną u dzika (Sus scrofa scrofa) o kariotypie 36,XY,rob(15;17), który został wstępnie zdiagnozowany na podstawie prążków G (technika GTG). Do międzygatunkowych hybrydyzacji wykorzystano dwie komercyjne, różnie znakowane ludzkie sondy malujące dla chromosomów par 2. i 20. FISH z ludzką sondą WCP 20 ujawniła zielone sygnały hybrydyzacyjne na krótkich ramionach translokowanych chromosomuów15;17, a po hybrydyzacji z WCP 2 żółte sygnały obserwowane byływzdłuż długich ramion tych zreorganizowanych akrocentrycznych autosomów. Wyniki międzygatunkowych hybrydyzacji in situ potwierdziły wstępną cytogenetyczną ocenę kariotypu dzika – nosiciela translokacji robertsonowskiej, a także liczne homologie i homeologie między chromosomami człowieka i gatunków należących do rodziny Suidae (Sus scrofa domestica i Sus scrofa scrofa). Uzyskane wyniki potwierdziły także przydatność komercyjnych ludzkich sond malujących do identyfikacji chromosomowych rearanżacji u innych, mało poznanych, gatunków.

Słowa kluczowe

EN

pig; wild animal; cross-species hybridization; in situ; identification; Robertsonian translocation; wild boar; karyotype

• Wydawca: -
• Czasopismo: Annals of Warsaw University of Life Sciences - SGGW. Animal Science
• Rocznik: 2017
• Tom: 56[1]
• Opis fizyczny: p.15-21,fig.,ref.

Twórcy

autor

Babicz M.

• Department of Pig Breeding and Production Technology, University of Life Sciences in Lublin, Akademicka 13, 20-950 Lublin Poland

autor

Danielak-Czech B.

• Department of Animal Genomics and Molecular Biology, National Institute of Animal Production, Balice/Krakow, Poland

autor

Kozubska-Sobocinska A.

• Department of Animal Genomics and Molecular Biology, National Institute of Animal Production, Balice/Krakow, Poland

Bibliografia

• BARASC H., FERCHAUD S., MARRY N., CUCCHI M.A., LUCENA A.N., RAYMOND- LETRON I., CALGARO A., BONNET N., DUDEZ A.M., YERLE M., DUCOS A., PINTON A., 2014. Cytogenetic analysis of somatic and germinal cells from 38,XX/38,XY phenotypically normal boars. Theriogenology 81: 368-872.
• BOSMA A.A., 1976: Chromosomal polymorphism and G-banding patterns in the wild boar (Sus scrofa L.) from the Netherlands. Genetica 46: 391-399.
• DANIELAK-CZECH B., KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., REJDUCH B., 2010: Diagnosis of tandem fusion translocation in the boar using FISH technique with human painting probes. Ann. Anim. Sci. 10: 361-366.
• DANIELAK-CZECH B., KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., REJDUCH B., 2013a: Diagnostyka cytomolekularna w nowoczesnej hodowli zwierząt gospodarskich. Wiad. Zoot. LI 4: 58-64.
• DANIELAK-CZECH B., KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., REJDUCH B., 2016: Molecular cytogenetics in the diagnostics of balanced chromosome mutations in the pig (Sus scrofa) - a review. Ann. Anim. Sci. 16 (3): 1-21.
• DANIELAK-CZECH B., REJDUCH B., KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., 2013b: Identification of telomeric sequences in pigs with rearranged karyotype using PRINS technique. Ann. Anim. Sci. 13 (3): 495-502.
• DANIELAK-CZECH B., SŁOTA E., 2008: Karyotype control system of AI boars in Poland: the current survey. Ann. Anim. Sci. 3: 255-262.
• DOLEŻEL J., VRÂNA J., SAFÂR J., BAR­TOS J., KUBALÂKOVÂ M., SIMKOVÂ H., 2012. Chromosomes in the flow to simplify genome analysis. Funct. Integr. Genomics 12: 397-416.
• DUCOS A., REVAY T., KO VACS A., HIDAS A., PINTON A., BONNET-GARNIER A., MOLTENI L., SŁOTA E., ŚWITOŃSKI M., ARRUGA M.V., VAN HAERINGEN W.A., NICOLAE I., CHAVES R., GUEDESPINO H., ANDERSSON M., IANNUZZI L., 2008: Cytogenetic screening of livestock populations in Europe: an overview. Cytogenet. Genome Res. 120: 26-41.
• FRONICKE L., CHOWDHARY B.P., SCHER- THAN H., GUSTAVSSON I., 1996: A compar­ative map of the porcine and human genomes demonstrates ZOO-FISH and gene mapping­based chromosomal homologies. Mamm. Ge­nome 7: 285-290.
• GOUREAU A., YERLE M., SCHMITZ A., RIQUET J., MILAN D., PINTON P., FRELAT G., GELLIN J., 1996: Human and porcine cor­respondence of chromosome segments using bidirectional chromosome painting. Genomics 3: 252-262.
• GUSTAVSSON I., 1988: Standard karyotype of domestic pig. Hereditas 109: 151-157.
• GUSTAVSSON I., 1990: Chromosomes of the pigs. Adv. Vet. Sci. Comp. Med. 34: 7-107.
• GUSTAVSSON I., HAGELTORN M., ZECH L., REILAND S., 1973: Identification of the chromosomes in a centric fusion/fission polymor­phic system of the pig (Sus scrofa L.). Hereditas 75: 153-155.
• JIANG Z., ROTHSCHILD M.F., 2007: Swine genome science comes to age. Int. J. Biol. Sci. 3: 129-131.
• KOCIUCKA B., SZCZERBAL I., BUGAJ S., ORSZTYNOWICZ M., ŚWITOŃSKI M., 2014. A high incidence of adjacent-1 meiotic segregation pattern, revealed by multicolor sperm FISH, in a carrier boar of a new reciprocal translocation t(6;16)(p13;q23). Cytogenet. Cell Genet. 142: 21-27.
• KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., DANIELAK- CZECH B., BĄK A., BABICZ M., REJ-DUCH B., 2014: Comparative physical mapping of genes associated with meat production traits in the wild pig genome. Chromosome Res. 22: 414.
• KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., DANIELAK- CZECH B., BABICZ M., 2015: Cross-species hybridizations in situ of genes associated with meat production traits in the wild pig genome. Ann. UMCS, sect. EE, Zootechnica. 33 (3): 31-36.
• PINTON A., CALGARO A., BONNET N., MARY N., DUDEZ A.M., BARASC H., PLARD C., YERLE M., DUCOS A., 2012: Contrôle chromosomique des populations porcines en France: bilan 2007-2010. Journées Recherche Porcine 44: 43-44.
• REJDUCH B., DANIELAK-CZECH B., KO- ZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., 2010a: FISH­based comparative analysis of human and porcine chromosome region involving obesity­related genes. Ann. Anim. Sci. 10: 367-372.
• REJDUCH B., KOZUBSKA-SOBOCIŃSKA A., DANIELAK-CZECH B., 2010b: Use of human painting probes for identification of centric fusion in wild boar. Chromosome Res. 18: 727-728.
• REJDUCH B., SŁOTA E., RÓŻYCKI M., KOŚCIELNY M., 2003: Chromosome number polymorphism in a litter of European wild boar (Sus scrofa scrofa L.). Anim. Sci. Pap. Rep. 21: 57-62.
• RETTENBERGER G., KLETT C., ZECHNER U., KUNZ J., VOGL W., HAMEI- STER H., 1995: Visualization of the conserva­tion of synteny between humans and pigs by heterologous chromosomal painting. Genomics 26: 372-378.
• RUBES J., PINTON A., BONNET-GARNIER A., FILLON V, MUSILOVA P., MICHALO- VA K., KUBICKOVA S., DUCOS A., YERLE M., 2009: Fluorescence in situ hybridization applied to domestic animal cytogenetics. Cytogenet. Genome Res. 126: 34-48.
• SŁOTA E., DANIELAK-CZECH B., 2010: Za­stosowanie metod cytogenetyki molekularnej w diagnostyce i profilaktyce wad genetycznych u świń. In: Zastosowanie osiągnięć naukowych z zakresu genetyki i biotechnologii rozrodu w nowoczesnej produkcji trzody chlewnej. Rocz. Nauk Zoot. Monogr. Rozpr. 44: 9-20.
• SYSA P.S., SŁAWOMIRSKI J., GROMADZKA J., 1984: Remarks on cytogenetic studies on crossing wild boar (Sus scrofa fereus) and do­mestic pig (Sus scrofa dom.). Pol. Arch. Wet. 24: 90-95.
• TROSHINA A., GUSTAVSSON I., TIKHONOV V.N., 1985: Investigation of two centric fusion translocations of wild pigs by different banding techniques. Hereditas. 202: 155-158.
• WNUK M., KOTYLAK Z., BUGNO M., SŁOTA E., 2005: Karyotype analysis in pigs - hybrids of European wild boar (Sus scrofa scrofa) and domestic pig (Sus scrofa domestica). Ann. Anim. Sci. 5: 11-19.
• YERLE M., ECHARD G., ROBIC A., MAIRAL A., DUBUT-FONTANA C., RIQUET J., PIN­TON P., MILAN D., LAHBIB-MANSAIS Y, GELLIN J., 1996: A somatic cell hybrid panel for pig regional gene mapping characterized by molecular cytogenetics. Cytogenet. Cell Genet. 73: 194-202.

Identyfikatory

DOI

10.22630/AAS.2017.56.1.2