PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2013 | 12 | 4 |

Tytuł artykułu

An analysis of PPARGC1A gene polymorphism in relation to carcass quality in PIC hybrid fatteners

Treść / Zawartość

Warianty tytułu

PL
Analiza polimorfizmu genu PPARGC1A w odniesieniu do cech tuszy tuczników hybrydowych PIC

Języki publikacji

EN

Abstrakty

EN
The aim of this study was to determine the association between polymorphism located in exon 8 of PPARGC1A gene (Cys430Ser) and carcass quality in pigs. Experiment was carried out on 350 PIC hybrid fatteners. Polymorphism was analyzed using PCR-RFLP method. The frequency of genotypes was as follows: AA – 0.33, AT – 0.57, TT – 0.1, however alleles: A – 0.62, T – 0.38. In the analyzed population loss of Hardy-Weinberg equilibrium was observed (P ≤ 0.01). Statistical analysis showed that only one of the evaluated traits was associated with individual PPARGC1A genotypes. Cooling loss value for pig carcasses with TT genotype was statistically significant (P ≤ 0.05) higher than observed in those with AA and AT genotypes.
PL
Celem niniejszych badań było wykazanie zależności pomiędzy polimorfizmem zlokalizowanym w 8 eksonie genu PPARGC1A (Cys430Ser) a cechami tuszy świń. Eksperyment został przeprowadzony na 350 tucznikach hybrydowych PIC. Polimorfizm analizowano z użyciem metody PCR-RFLP. Frekwencja genotypów była następująca: AA - 0.33, AT - 0.57, TT - 0.1, natomiast alleli: A - 0.62, T - 0.38. W analizowanej populacji zaobserwowano zachwianie równowagi genetycznej Hardy’ego-Weinberga (P ≤ 0,01). Analiza statystyczna wykazała, że tylko jedna z ocenianych cech była powiązana z poszczególnymi genotypami PPARGC1A. Wartość strat chłodzenia (%) dla świń z genotypem TT była statystycznie istotnie (P ≤ 0,05) wyższa niż obserwowana u osobników z genotypami AA i AT.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

12

Numer

4

Opis fizyczny

p.71-77,ref.

Twórcy

autor
  • Department of Genetics and Animal Breeding, West Pomeranian University of Technology in Szczecin, Doktora Judyma 6, 71-466 Szczecin, Poland
autor
  • West Pomeranian University of Technology in Szczecin, Szczecin, Poland
autor
  • West Pomeranian University of Technology in Szczecin, Szczecin, Poland

Bibliografia

  • AOAC, 2003. Official methods of analysis of AOAC international (17th ed.). Gaithersburg, MD USA: Association of Official Analytical Chemists (AOAC) International.
  • Erkens T., Rohrer G.A., van Zeveren A., Peelman L„ 2009. SNP detection in the porcine PPARGC1A promoter region and 3’UTR and an association analysis in a Landrace- Duroc-Yorkshire population. Czech J. Anim. Sci., 54 (9), 408-416.
  • Flisar T., Kunej T., Kovac M., Dovc P., 2006. Effect of PPARGC-1 gene on backfat thickness in pigs. Acta Agriculturae Slovenica 88 (1), 11-18.
  • Gandolfi G., Cinar M.U., Ponsuksili S. Wimmers K., Tesfaye D., Looft C., Jüngst H., Tholen E., Phatsara C., Schellander K., Davoli R., 2011. Association of PPARGC1A and CAPNS1 gene polymorphisms and expression with meat ąuality traits in pigs. Meat Sci., 89 (4), 478-485.
  • Jacobs K., Rohrer G., Van Poucke M., Piumi F., Yerle M., Barthenschlager H., Mattheeuws M., Van Zeveren A., Peelman L.J., 2006. Porcine PPARGC1A (peroxisome proliferative activated receptor gamma coactivator 1 A): coding seąuence, genomie organization, polymorphisms and mapping. Cytogenet Genome Res., 112(1-2), 106-113.
  • Kim J.M., Lee K.T., Lim K.S., Park E.W., Lee Y.S., Hong K.C., 2010. Effects of p.C430S polymorphism in the PPARGC1A gene on muscle fibrę type composition and meat ąuality in Yorkshire pigs. Anim.Genet., 41 (6), 642-645.
  • Kunej T., Wu X.-L., Berlic T.M., Michał J.J., Jiang Z., Dovc P, 2005. Freąuency distribution of a Cys430Ser polymorphism in peroxisome proliferator-activated receptor- gamma coactivator-1 (PPARGC1) gene seąuence in Chinese and Western pig breeds. J Anim Breed Genet., 122(1)7-11.
  • Lin J., Wu H., Tarr P.T., Zhang C.Y., Wu Z., Boss O., Michael L.F., Puigserver P., Isotani E., Olson E.N., Lowell B.B., Bassel-Duby R., Spiegelman B.M., 2002. Transcriptional coactivator PGC-l[alpha] drives the formation of slow-twitch muscle fibres, Naturę, 418(6899) 797-801.
  • Liu R., Li J.L., Lv X.B., 2011. Association of PGC-la Gene with Intramuscular Fat Content and Muscle Fiber Traits and Gene Expression in Tibetan Pigs. J. Anim. Vet. Adv„ 10(17), 2301-2304.
  • Liu K., Muse S.V., 2005. Powermarker: an integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 1 (9), 2128-2129.
  • Margeta V., Frajman P., Kralik G., Dovč P., 2006. Determination of PPARGC1 Cys430Ser polymorphism and MHS genotype in Croatian autochthonous pig breeds. Acta Agraria Kaposváriensis 10 (2), 333-339.
  • Puigserver P., Spiegelman B.M., 2003. Peroxisome proliferator-activated receptor-gamma coactivator 1 alpha(PGC-l alpha): transcriptional coactivator and metabolic regulator. Endocr. Rev„ 24 (1) 78-90.
  • Stachowiak M., Szydłowski M., Cieślak J., Switonski M., 2007. SNPs in the porcine PPARGCla gene: interbreed differences and their phenotypic effects. Celi Mol. Biol. Lett., 12(2), 231-239.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-47a0d1f3-1f2b-4206-ad6f-4e012de7ed80
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.