Zastosowanie techniki RAPD-PCR do oceny pokrewieństwa genetycznego odmian, klonów oraz podkładek jabłoni polskiej hodowli

• Autorzy: Kuras A. , Korbin M. , Jakubowski T. , Zurawicz E.

Warianty tytułu

EN

Suitability of RAPD-PCR technique for genetic relationship evaluation of cultivar clones and apple rootstocks of Polish breeding

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Zastosowanie techniki RAPD-PCR pozwoliło na wykazanie zróżnicowania genetycznego w obrębie puli genowej 23 odmian/klonów jabłoni oraz 19 podkładek jabłoni, stanowiących formy rodzicielskie w programach krzyżowań bądź będących genotypami pochodzącymi z polskiej hodowli. Polimorfizm DNA, wskazujący na zróżnicowanie badanego materiału roślinnego, stwierdzono w reakcji z dziesięcioma (dla genotypów jabłoni) i dwunastoma (dla podkładek) spośród 61 testowanych starterów z grup OPA, OPB, OPW, OPE i OPP (Operon Technologies Inc., USA). Ostatecznie wybrano osiem starterów (OPA-0l, OPA-02, OPA-05, OPA-08, OPA-15, OPA-16, OPW-06, OPP-02), umożliwiających odróżnienie odmian jabłoni i cztery startery (OPA-0l, OPA-05, OPA-08, OPB-07), w reakcjach, z którymi uzyskiwano produkty odróżniające badane podkładki. Na podstawie wyników RAPD-PCR ustalono stopień pokrewieństwa odmian i podkładek jabłoni.

EN

Genetic diversity of 23 cultivars/clones of apple and 19 apple rootstocks, the parental forms for crossing programs or genotypes deriving from Polish breeding, was determined using RAPD-PCR technique. DNA polymorphism, showing diversity of analyzed plant material, was observed in reactions with 10 apple genotypes and 12 apple rootstocks out of 61 chosen primers from groups OPA, OPB, OPW, OPE and OPP (Operon Technologies Inc., USA). Finally, 8 (OPA-0l, OPA-02, OPA-05, OPA-08, OPA-15, OPA-16, OPW-06, OPP-02) and 4 (OPA-0l, OPA-05, OPA-08, OPB-07) primers were selected for differentiating all tested apple cultivars and rootstocks, respectively. Basing on RAPD-PCR data the degree of genetic relationship of analyzed cultivars and rootstocks was determined.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2004
• Tom: 497
• Numer: 2
• Opis fizyczny: s.391-397,tab.,rys.,bibliogr.

Twórcy

autor

Kuras A.

• Zakład Hodowli Roślin Sadowniczych, Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa, ul.Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice

autor

Korbin M.

• Zakład Hodowli Roślin Sadowniczych, Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa, ul.Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice

autor

Jakubowski T.

• Zakład Hodowli Roślin Sadowniczych, Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa, ul.Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice

autor

Zurawicz E.

• Zakład Hodowli Roślin Sadowniczych, Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa, ul.Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice

Bibliografia

• Archaik S., Gaikwad A.B., Gautam D., Rao E.V., Swamy K.R., Karihaloo J.L. 2003. Comparative assessment of DNA fingerprinting techniques (RAPD, ISSR and AFLP) for genetic analysis of cashew (Anacardium accidentale L.) accessions of India. Genome 46(3): 362-369.
• Autio W.R., Schupp J.R., Ferree D.C., Glavin R., Mulcahy D.L. 1998. Application of RAPDs to DNA extracted from apple rootstocks. HortScience 33: 333-335.
• Brown P.T.H., Lange F.D., Kranz E., Lörz H. 1993. Analysis of single protoplasts and regenerated plants by PCR and RAPD technology. Mol. Gen. Genet. 273: 311-317.
• Conner P.J., Bron S.K., Weeden N.F. 1997. Randomly amplified polymorphic DNA- based genetic linkage maps of the three apple cultivars. J. Am. Soc. Hort. Sci. 122: 1027-1035.
• Doyle J.J., Doyle J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12: 13-15.
• Dunemann F., Kahnau R., Schmidt H. 1994. Genetic relationship in Malus evaluated by RAPD fingerprinting of cultivars and wild species. Plant Breeding 113(2): 150-159.
• González-Horta A., Martínez-Peniche R.A., Castańo-Tostado E. 2003. Analysis of low chilling apple (Malus spp.) populations from central Mexico based on molecular markers RAPD. Acta Hort. 606: 41-44.
• Hancock J.F., Callow P.A., Shaw D.V. 1994. Randomly amplified polymorphic DNAs in the cultivated strawberry, Fragaria x ananassa. J. Amer. Soc. Hort. Sci. 119: 862-864.
• Hu J., Quiros S.F. 1991. Identification of broccoli and cauliflower cultivars with RAPD markers. Pl. Cell Rep. 10: 505-511.
• Koga-Ban Y., Kudo T., Ishiyama M., Suzuki M., Kon T. 1998. RAPD analysis of hybrid seedlings from a wild apomictic apple parental line. Acta Hort. 484: 363-366.
• Koller B., Lehmann A., McDermott J.M. Gessler C. 1993. Identification of apple cultivars using RAPD markers. Theor. Appl. Genet. 85: 901-904.
• Kuras A., Szafran E., Wróblewski T., Żurawicz E. 1997. Wyniki wstępnych prac nad identyfikacją odmian i klonów jabłoni techniką RAPD. Materiały z I Krajowej Konferencji „Hodowla Roślin”. Poznań, 19-20 XI: 439-445.
• Landry B.S., Li R.Q., Cheung W.Y., Granger R.L. 1994. Phytogeny analysis of 25 apple rootstocks using RAPD markers and tactical tagging. Theor. Appl. Genet. 89: 847-852.
• Maliepaard C., Alston F.H., Arkel G., Brown L.M., Chevreau E., Dunemann F., wvans K.M., Gerdiner S., Giulford P., Heusden A.W., Janse J., Laurens F., Lynn J.R.S., Schmidt H., Tartarini S., Verhaegh J.J., Vrieling E., Roche P., Ryder C., Sansavini G., van Hansden A.W., Den Nijs A.P.M. 1998. Aligning male and female linkage maps of apple (Malus pumila Mill.) using multi-allelic markers. Theor. Apel. Genet. 97: 1-2, 60-70, 3 ref.
• Martelli G., Sunseri F., Greco I., Sabina M.R., Porreca P., Levi A. 1999. Strawberry cultivars genetic relationship using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Adv. Hort. Sci. 13: 99-104.
• Millan T., Osuna F., Cobos A., Torres A.M., Cubero J.I. 1996. Using RAPDs to study phylogenetic relationships in Rosa. Theor. Apel. Genet. 92: 273-277.
• Moreno S., Gogorcena Y., Ortiz J.M. 1995. The use of RAPD markers for identification of cultivated grapevine (Vitis vinifera L.). Sc. Horticulture 62: 237-243.
• Patzak J., Oriniakowá P., Matoušek J., Svoboda P. 1999. Czech hop characterisation using RAPD method and genetic distance analysis of selected genotypes. Pl. Prod. 45: 165-172.
• Waudh R., Powell W. 1992. Using RAPD markers for crop improvement. Trends Biotech. 10: 186-191.
• Williams J.G.K., Kubelik A.R., Lizak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 18: 6531-6535.
• Zhen-Xiang L., Reighard G.I., Baird W.V. 1996. Identification of peach rootstock cultivars bt RAPD markers. HortScience, Vol. 31: 127-129.
• Yang H., Krüger J. 1994. Identification of RAPD marker linked to the Vf gene for scar resistance in apples. Plant Breeding 112: 323-329.