Utilization of the selected microsatellite sequences in optimizing the mating plan in an experimental flock of Ayam Cemani breed

• Autorzy: Gruszczynska J. , Lukasiewicz M. , Grzegrzolka B.

Warianty tytułu

PL

Wykorzystanie wybranych sekwencji mikrosatelitarnych w optymalizacji planu kojarzeń doświadczalnego stada kur rasy ayam cemani

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The parental flock initially included 2 cocks and 9 hens, that originated from different breeding farms, and then the following F1 generation included 42 birds (15 hens and 27 cocks). The experimental flock of Ayam Cemani breed was bred at the Poultry Farm of the University of Life Sciences in Wilanów-Obory. Owing to the specific character of the experiment, the following microsatellite sequences were selected based on literature data: MCW0145, MCW0184, MCW0210, LEI0071, and ADL0306, all being linked with the body weight of hens (Atzmon et al., 1998; Atzmon et al., 2008; Weissmann et al., 1998; Tatsuda and Fujinaka, 2001). The earlier investigations demonstrated that the microsatellite sequences investigated in chicken of the Ayam Cemani breed were polymorphic (Gruszczyńska and Łukasiewicz, 2010). Results of molecular analyses enabled determining the genetic distance between all pairs of birds in the flock. It was demonstrated that the chosen microsatellite sequences might be successfully used as genetic markers in the tests concerning chicken origin. The method involving the use of microsatellite sequences in order to determine the genetic distance and then to optimize the mating plan turned out to be successful, for in the experimental flock the hatchability from set eggs increased to a highly significant extent from 50.1% to 74.1%.

PL

Wykorzystanie wybranych sekwencji mikrosatelitarnych w optymalizacji planu kojarzeń doświadczalnego stada kur rasy ayam cemani. Stado rodzicielskie liczyło początkowo 2 koguty i 9 kur, które pochodziły z różnych hodowli, a następne uzyskane po nich pokolenie F1 liczyło 42 ptaki (15 kur i 27 kogutów). Stado doświadczalne pochodziło z fermy drobiu Rolniczego Zakładu Doświadczalnego SGGW Wilanów-Obory. Ze względu na specyfikę prowadzonego doświadczenia na podstawie literatury wybrano sekwencje mikrosatelitarne: MCW0145, MCW0184, MCW0210, LEI0071, ADL0306, które były u kur związane z masą ciała (Atzmon et al., 1998; Atzmon et al., 2008; Weissmann et al., 1998; Tatsuda and Fujinaka, 2001). We wcześniej przeprowadzonych badaniach stwierdzono, że wybrane sekwencje mikrosatelitarne u kur rasy ayam cemani są polimorficzne (Gruszczyńska and Łukasiewicz, 2010). Na podstawie wyników badań molekularnych wyznaczono dystans genetyczny między wszystkimi parami ptaków występujących w stadzie. Stwierdzono, iż wybrane sekwencje mogą być z sukcesem wykorzystywane w identyfikacji pochodzenia u kur. Metoda wykorzystania sekwencji mikrosatelitarnych w celu ustalenia dystansu genetycznego, a następnie na tej podstawie ustalenia planu kojarzeń okazała się trafna, gdyż w doświadczalnym stadzie wylęgowość z jaj nałożonych wzrosła wysoko istotnie statystycznie z 50,1% do 74,1%.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Annals of Warsaw University of Life Sciences - SGGW. Animal Science
• Rocznik: 2011
• Tom: 49
• Opis fizyczny: p.27-34,ref.

Twórcy

autor

Gruszczynska J.

• Department of Genetics and Animal Breeding, Warsaw University of Life Sciences – SGGW, Ciszewskiego 8, 02-786 Warsaw, Poland

autor

Lukasiewicz M.

autor

Grzegrzolka B.

Bibliografia

• ATZMON G., BAXTER-JONES C., YONASH N., CHENG H., AVIDAN N., LAVI U., CA- HANER A., HILLEL J., 1998: Microsatellite markers associated with quantitative traits in broilers. Proceedings, 10th European Poultry Conference” The Poultry Industry Towards the 21st Century”, Jerusalem Israel, 21-26 June, 1: 191-194.
• ATZMON G., BLUM S., FELDMAN M., CAHA- NER A., LAVI U., HILLEL J., 2008: QTLs de­tected in a multigenerational resource chicken population. The J. Hered. 99 (5): 528-538.
• BORZEMSKA W.B., 1996: Embriopatologia dro­biu. Drobiarstwo, 10: 5-9.
• BORZEMSKA W.B., 2005: Choroby drobiu. Pra­ca zbiorowa pod redakcją M. Mazurkiewicza. Wyd. Akad. Rol. we Wrocławiu, 69-124.
• BORZEMSKA W.B., KOSOWSKA G., 1997: Ważniejsze problemy w patologii lęgów u dro­biu. Zesz. Nauk. Przegl. Hod. 3: 25-31.
• BOWLING A.T., EGGLESTON-STOTT M.L., BYRNS G., CLARK R.S., DILEANIS S., WICTUM E., 1997: Validation of microsatelli­te markers for routine horse parentage testing. Anim. Genet. 28: 247-252.
• CROOIJMANS R.P., DIJKHOF R.J.M., POEL J.J., GROENEN M.A.M., 1997: New microsa­tellite markers in chicken optimized for auto­mate fluorescent genotyping. Anim. Genet. 28: 427-437.
• ROOIJMANS R.P., VAN OERS P.A., STRIJK J.A., VAN DER POEL J.J., GROENEN M.A., 1996: Preliminary linkage map of the chicken (Gallus domesticus) genome based on 77 mi­crosatellite markers: 77 new markers mapped. Poultry Sci. 75: 746-754.
• EVETT L.W., WEIR B.S., 1998: Interpreting DNA Evidence: Statistical Genetics for Foren­sic Scientists. Sinauer Associates. Inc., Sunder­land. MA.
• FREIS R., EGGEN A., STRANZIENGER G., 1990: The bovine genome contains polymor­phic microsatellites. Genomics 8: 403-440.
• FUNG W.K., CHUNG Y, WONG D., 2002: Po­wer of exclusion revisited: probability of exc­luding relatives of the true father from paterni­ty. Int J.Legal Med 116: 64-67.
• GANAI N.A., YADAV B.R., 2005: Parentage de­termination in three breeds of Indian goat using heterologous microsatellite markers. In: H.P.S. Makkar and G.J. Viljoen (eds.) Applications of Gene-Based Technologies for Improving Animal Production and Health in Developing Countries 613-620.
• GRUSZCZYŃSKA J., LUKASIEWICZ M., 2010: Microsatellite polymorphism in the stu­dy of genetic diversity of an experimental flock of Ayam Cemani breed, Ann. Warsaw Univ. of Life Sci. - SGGW, Anim. Sci. 47: 39-44.
• JAMIESON A., TAYLOR ST.C.S., 1997: Com­parisons of three probability formulae for parentage exclusion. Anim. Genet. 28: 397­-400.
• KALINOWSKI S.T., TAPER M.L., MARSHALL T.C., 2007: Revising how the computer pro­gram CERVUS accommodates genotyping er­ror increases success in paternity assignment. Mol. Ecol. 16: 1099-1006.
• NEI M., 1972: Genetic distance between popula­tions. The American Naturalist. 106: 283-291.
• OLIVEIRA S., TRINDADE-FILHO A., MEN- DES C., PAULA K., MAIA F., PAK H., DAL­TON G., 2006: Power of exclusion of 18 au- tosomic STR loci in a Brazilian Middle-West region population sample. International Con­gress Series 1288: 433-435.
• RADKO A., 2008: Ocena polimorfizmu marke­rów mikrosatelitamych DNA wykorzystywa­nych w kontroli rodowodów bydła w Polsce. Wiadomości Zootechniczne, R. XLVI, 4: 3-8.
• RIOJAS-VALDES V.M., GOMEZ DE LA FUEN­TE J.C., GARZA-LOZANO J.M., GALLAR- DO-BLANCO D.C., DE TELLITU_SCHUTZ J.N., WONG-GONZALEZ A., DAVALOS- ARANDA G., SALINAS-MELENDEZ J.A., 2009: Exclusion probabilities of 8 DNA mi­crosatellites in 6 cattle breeds from Northeast Mexico. J. of Anim. and Vet. Advences 8(1): 62-66.
• ROSARIO M.F., LEDUR M.C., MOURA A.S.A.T., COUTINHO L.L., GARCIA A.A.F., 2009: Genotypic characterization of micro­satellite markers in broiler and layer selected chicken lines and their reciprocal F1s. Sci. Agric. (Piracicaba, Braz.) 66: 150-158.
• SCHNABEL R.D., WARD T.J., DERR J.N., 2000: Validation of 15 microsatellites for pa­rentage testing in North American bison, Bison bison and domestic cattle. Anim. Genet. 31: 360-366.
• TADANO R., NISHIBORI M., NAGASAKA N., TSUDZUKI M., 2007: Assessing genetic di­versity and population structure for commer­cial chicken lines based on forty microsatellite analyses, Poultry Sci. 86: 2301-2308.
• TATSUDA K., FUJINAKA K., 2001: Genetic mapping of the QTL affecting body weight in chickens using a F2 family. Br. Poultry Sci. 42(3): 333-337.
• WEISSMANN S., CARMON T., DOUAIRE M., CAHANER A., ZEITLIN G., LAVI U., AVI- DAN N., LECLERCQ B., HILLEL J., 1998: Marker gene frequencies within and between divergently selected lines for high and low abdominal fat in chickens. Proceedings, 10th European Poultry Conference” The Poultry Industry Towards the 21st Century”, Jerusalem Israel, 21-26 June, 1: 280-283.
• WENK R.E., GJERTSON D.W., CHIAFARI F.A., HOUTZ T., 2005: The specific power of parentage exclusion in a child’s blood relatives. Transfusion 45: 440-444.

Uwagi

Rekord w opracowaniu